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Visium HD與含有mRNA的人類和小鼠福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織切片兼容。這包括存檔的FFPE蠟塊和載玻片上的預(yù)先切片的組織。

將組織學(xué)提升到一個(gè)新的水平

Visium HD空間基因表達(dá)與用于形態(tài)學(xué)分析的蘇木精和伊紅 (HE) 染色以及用于蛋白質(zhì)共檢測(cè)的免疫熒光 (IF) 染色兼容?？衫脕?lái)自同一組織切片的高分辨率空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)來(lái)提升對(duì)HE和IF成像樣本的分析。

Visium HD玻片：新一代的玻片結(jié)構(gòu)，實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞分辨率

Visium HD空間基因表達(dá)玻片包含兩個(gè)6.5 x 6.5 mm捕獲區(qū)域，其中寡核苷酸連續(xù)排列在數(shù)百萬(wàn)個(gè)無(wú)間隙的2 x 2 μm條形碼標(biāo)記的正方形中，實(shí)現(xiàn)單細(xì)胞級(jí)的空間分辨率。數(shù)據(jù)以2 μm正方形單位以及多個(gè)合并的分析單位輸出。8 x 8 μm大小的分析單位是推薦的可視化和分析的起始點(diǎn)。

Visium CytAssist：通過(guò)簡(jiǎn)單的工作流程獲得無(wú)與倫比的空間數(shù)據(jù)質(zhì)量

(1) 遵循標(biāo)準(zhǔn)的組織學(xué)操作流程，直接在載玻片上對(duì)組織進(jìn)行切片、染色和成像

(2)預(yù)篩選以找到最具生物學(xué)意義的組織切片

(3)無(wú)需優(yōu)化即可探索各種各樣的FFPE組織

數(shù)據(jù)分析：易于使用的可視化工具將組織學(xué)和基因表達(dá)數(shù)據(jù)無(wú)縫結(jié)合

10x Genomics提供兩種類型的軟件來(lái)幫助您分析數(shù)據(jù)：Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger是一款分析軟件，可自動(dòng)將空間基因表達(dá)信息疊加在組織圖像上，并識(shí)別具有相似轉(zhuǎn)錄特征的條形碼標(biāo)記的方塊簇。然后，您可以使用Loupe Browser（一種可視化軟件）以交互方式探索結(jié)果。您可以從10x Genomics支持網(wǎng)站免費(fèi)下載Space Ranger和Loupe Browser。

探索組織背景中的基因表達(dá)簇

將數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)映射到顯微鏡成像的H&E或IF圖像上

如果您有空間轉(zhuǎn)錄組需求，歡迎您聯(lián)系我們！