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新一代的玻片結構實現了單細胞水平的分辨率

Visium HD 空間基因表達玻片包含兩個6.5x6.5mm的捕獲區,其中含有約1100萬個2x2um帶有條形碼的方格,它們無間隙地排列成寡核苷酸連續區塊，實現單細胞水平的空間分辨率。數據能夠以2um以及多種拼接尺寸輸出。建議以8x8um拼接作為起點進行可視化和分析。

 

實現各種FFPE樣本的空間分析

Visium HD與含有mRNA的人類和小鼠福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 組織切片兼容。這包括存檔的FFPE蠟塊和載玻片上的預先切片的組織。

將組織學提升到一個新的水平

Visium HD空間基因表達與用于形態學分析的蘇木精和伊紅 (HE) 染色以及用于蛋白質共檢測的免疫熒光 (IF) 染色兼容。可利用來自同一組織切片的高分辨率空間轉錄組學數據來提升對HE和IF成像樣本的分析。

Visium HD玻片：新一代的玻片結構，實現單細胞分辨率

Visium HD空間基因表達玻片包含兩個6.5 x 6.5 mm捕獲區域，其中寡核苷酸連續排列在數百萬個無間隙的2 x 2 μm條形碼標記的正方形中，實現單細胞級的空間分辨率。數據以2 μm正方形單位以及多個合并的分析單位輸出。8 x 8 μm大小的分析單位是推薦的可視化和分析的起始點。

Visium CytAssist：通過簡單的工作流程獲得無與倫比的空間數據質量

(1) 遵循標準的組織學操作流程，直接在載玻片上對組織進行切片、染色和成像

(2)預篩選以找到最具生物學意義的組織切片

(3)無需優化即可探索各種各樣的FFPE組織

 

數據分析：易于使用的可視化工具將組織學和基因表達數據無縫結合

10x Genomics提供兩種類型的軟件來幫助您分析數據：Space Ranger和Loupe Browser。Space Ranger是一款分析軟件，可自動將空間基因表達信息疊加在組織圖像上，并識別具有相似轉錄特征的條形碼標記的方塊簇。然后，您可以使用Loupe Browser（一種可視化軟件）以交互方式探索結果。您可以從10x Genomics支持網站免費下載Space Ranger和Loupe Browser。

探索組織背景中的基因表達簇

 

將數千個基因的表達映射到顯微鏡成像的H&E或IF圖像上

如果您有空間轉錄組需求，歡迎您聯系我們！